Indel

Indel es un término de la biología molecular que tiene definiciones diferentes en campos diferentes:

En la codificación de regiones del genoma, a menos que la longitud de un indel sea un múltiplo de 3, producen una mutación frameshift. Por ejemplo, microindel común que causa un frameshift causa el síndrome de la Flor en la población japonesa. Indels se puede contrastar con una mutación del punto; donde Indel inserta y suprime nucleotides de una secuencia, una mutación del punto es una forma de substitución que sustituye uno de los nucleotides. Indels también se puede contrastar con Tandem Base Mutations (TBM), que pueden resultar de mecanismos fundamentalmente diferentes. Un TBM se define como una substitución a nucleotides contiguo (principalmente substituciones a dos nucleotides contiguos, pero las substituciones a tres nucleotides contiguos se han observado.

Indels, tan definido como una introducción o eliminación, se puede usar como marcadores genéticos en poblaciones naturales, sobre todo en estudios de phylogenetic.

Un cambio indel de una base del ADN sola codificación de la parte de un mRNA causa un "frameshift" traduciendo el mRNA y quizás leyendo en una parada (prematura) inadecuada codon en un marco diferente. Indels que no son múltiplos de 3 son particularmente poco comunes en la codificación de regiones, pero relativamente comunes en la no codificación de regiones. Hay aproximadamente 192-280 frameshifting indels en cada persona

. Note, sin embargo, el precio absoluto de indels en los genomas más conocidos, incluso la gente, tiende a ser marcadamente más bajo que substituciones bajas, excepto cerca de regiones muy reiterativas, incluso homopolymers y microsatélites.

El término "indel" ha sido cooptado en años recientes por científicos del genoma para el uso en el sentido descrito encima. Esto es un cambio de su uso original y sentido, que provino de la sistemática. En la sistemática, los investigadores podrían encontrar diferencias entre secuencias, tal como de dos especies diferentes. Pero era imposible deducir si una especie perdiera la secuencia o las otras especies lo ganaron. Por ejemplo, la especie A tiene una carrera de 4 G nucleotides en un lugar geométrico y la especie B tiene 5 G en el mismo lugar geométrico. Si el modo de selección es desconocido, no podemos contar si las especies uno perdido G (un acontecimiento "de eliminación"") o las especies B ganaron un G (un acontecimiento de la "introducción"). Cuando no podemos deducir la dirección phylogenetic del cambio de la secuencia, el acontecimiento del cambio de la secuencia se menciona como un "indel".



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